Lalu, Ia menjabat Ketua PP Muhammadiyah 2005-2010 dan 2010-2015 di bawah kepemimpinan dua periode Din Syamsuddin.
Haedar juga kerap menulis beberapa buku-buku terkait Muhammadiyah. Paling terkenal adalah bukunya berjudul ‘Muhammadiyah Gerakan Pembaruan’.
BACA JUGA:Tol Palembang-Jambi Dibangun 2023, Mudik Hanya Butuh Waktu 4 Jam
Ia juga menulis buku ‘Memahami Ideologi Muhammadiyah’, ‘Islam Syariat’, ‘Muhammadiyah Abad Kedua’ hingga ‘Menggugat Modernitas Muhammadiyah: Refleksi Satu Abad Perjalanan Muhammadiyah’.
Saat menjabat di periode pertama kepemimpinannya, Muhammadiyah telah merambah mancanegara untuk membangun beragam fasilitas pendidikan.
Di antaranya mendirikan TK di Mesir, TK dan SD di Melbourne, Australia, serta perguruan tinggi di Malaysia. (*)